Парнапарин натрия - кислый полисахарид, который образует нерастворимые комплексы с основаниями. По этой причине раствор парнапарина натрия несовместим с растворами витамина К, витаминов группы В, гидрокортизона, гиалуронидазы, кальция глюконата, четвертичных аммониевых оснований, хлорамфеникола, тетрациклина и аминогликозидов.